La principal tarea del el Centro de Investigación Periodística (CIPER) es realizar periodismo de investigación riguroso, que fiscaliza al poder y entrega a la ciudadanía información de interés público que contribuya a profundizar la democracia.
Sus profesionales hacen uso sistemático de las leyes chilenas que norman el libre acceso a la información, de manera que los documentos que se obtengan por esta vía estén puestos a disposición de sus lectores sin restricciones.
Según los principios declarados en su sitio web, CIPER "es una institución sin fines de lucro e independiente de partidos y grupos económicos y religiosos cuya misión principal es realizar reportajes de investigación con los estándares más altos de rigurosidad, calidad e integridad profesional". A través de ellos, buscan ser un medio de comunicación que contribuya a tener una mejor democracia, políticas públicas de calidad, mayor transparencia, mejor calidad de vida de los ciudadanos y menor corrupción, entre otros objetivos.
CIPER se financia principalmente a través de sus lectores, mediante un sistema de membresías desde 2019. Actualmente 80% de sus ingresos viene de esta vía.